１、二者的基本性质不同。
准婚姻关系的性质是亚婚姻的事实状态，不是婚姻形式。而事实婚姻是一种婚姻关系。
２、二者的当事人合意的内容不同。
准婚姻关系双方当事人的合意，是共同居住，共同生活，并不具有结为夫妻的合意。而事实婚姻的当事人之间具有结婚的合意，彼此愿意永久地成为夫妻，以夫妻的身份共同生活。
３、二者对外公示的内容不同。
准婚姻关系是公开的两性结合关系，仅仅是异性的同居者。而事实婚姻对外的公示内容是双方结为配偶，而不是一般的两性同居，因此具有原则的区别。
４、二者当事人之间的权利义务不同。
在准婚姻关系，双方当事人之间不发生权利义务关系，而事实婚姻的双方当事人发生配偶的权利义务关系。
５、二者的财产关系内容不同。
准婚姻关系的当事人在同居期间，在财产上究竟采用何种体制，在于他们之间的合意，而事实婚姻的财产制适用关于婚姻财产关系的规定。