1、本罪侵犯的客体，主要是公共财产的所有权，同时在一定程度上也侵犯了国家的财经管理制度。挪用公款罪侵犯的直接客体是公款的使用权，同时行为人挪用公款后必然占有，有的还因此获得收益。而所有权包括占有、使用、收益、处分四种相互联系又具有相对独立性的权能，因此对所有权权能的侵犯也必然是对所有权的侵犯。所有权被侵犯并不意味着所有权转移。
任何财产犯罪实际上都不可能真正取得所有权，挪用公款罪与贪污一样都侵犯了财产所有权，不同之处只是在于所有权被侵犯的程度不同而已。同时，正因为挪用公款罪直接侵犯了公款的使用权，而这是违反国家财经管理制度中的公款使用制度的，因而它又侵犯了国家财经管理制度。
但是，由于挪用公款侵犯的主要客体是国家公共财产所有权，挪用公款罪所侵犯的2、客体包括：
一是国有财产的所有权；
二是劳动群众集体财产的所有权；
三是用于扶贫和其他公益事业的社会捐助或专项基金的财产的所有权；
四是在国家机关、国有公司、企业、集体企业和人民团体管理、使用或运输中的私人财产的所有权；
五是非国有公司、企业以及其他非国有单位资金的所有权；
六是非国有金融机构中客户资金的所有权，其中，挪用公款罪的犯罪对象，既包括当然的公共资金款项，也包括拟定的公共资金款项。