染色珍珠的染色方法是用染料渗透到珍珠的里层，达到染色目的，有机染料是染色金珍珠的致色成分。淡水珠质地较软，短则几个小时，长则几天就可以达到目的。南珠珠质较硬，也仅需2个月左右时间。南洋珠的珠质更致密，须用强光照射加以辅助，加速染料的渗透和均匀分布，这就是市面上说的“激光染色”、“辐射染色”、“烤色”等称呼，此法同样需要1-2个月，而且成本很高，加上染色失败和外带经济和法律上的风险，故此法应用较少。天然金珍珠的主要致色成分是金属离子、卟啉和类胡萝卜素，染色珍珠颜色分布不均匀，在孔眼内或表面破损处可看到染料的沉淀浓集;紫外可见吸收光谱法是目前较为常用的鉴定方法，天然金珍珠主要吸收峰位于350-360nm，而染色金珍珠则出现明显的410-450nm谱峰;应用拉曼光谱法鉴定可获得天然金珍珠在275cm-1明显的特征峰，而染色金珍珠出现强的荧光背景峰;应用荧光光谱法鉴定金黄色天然珍珠在376nm处光激发时谱峰是以472nm为中心，而染色珍珠在372nm处受光激发时谱峰位于436nm。