豆芽发黑了不能吃的，在豆芽生产销售过程中，添加任何添加剂，豆芽就会和相关添加剂发生反应，变成褐色或黑色。这种受污染的豆芽，最好不要食用。避免影响到身体健康。特别是豆芽上有发粘现象的，千万不要吃，那是黄曲霉素，毒性很大，会威胁到身体健康的。

保存时，首先，将变成褐色的根须掐掉，因为上面易沾细菌。然后，把豆芽用清水洗净，放入开水中焯1至2分钟后捞起，这样更能保住水分。控干水后，再把豆芽放入保鲜袋中，尽量排出袋内空气，密封保存。最后，再放入冰箱冷藏。不同的豆芽保存的时间长短也不一样的。黄豆芽保存的时间较长，绿豆芽则较短。