新鲜香菇置于冰箱冷藏，要用透气膜包装，可保鲜一星期左右，干香菇则应放在密封罐中进行保存，并最好每个月取出，放置阳光下曝晒一次，可保存半年以上。

储存香菇时，要避光储存，必须避免在强光下贮存香菇，同时也要避免用透光材料包装；要密封储存，可用铁罐、陶瓷缸等可密封的容器装贮香菇，容器应内衬食品袋。要尽量少开容器口，有条件的可用抽氧充氮袋装贮。香菇必须在低温通风处贮存，所以可把装香菇的容器密封后置于冰箱或冷库中贮存。将生鲜香菇放入冰箱之冷冻库存放，可延长保存期，使用前解冻即可，但不可反复冷冻。